Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00596Q86U02 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00596Q86U02 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00596Q86U02 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms