Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4DQ86TL0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4DQ86TL0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4DQ86TL0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms