Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPM2Q86SE8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NPM2Q86SE8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPM2Q86SE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NPM2Q86SE8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPM2Q86SE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms