Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LIMS2Q7Z4I7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMS2Q7Z4I7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIMS2Q7Z4I7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LIMS2Q7Z4I7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms