Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC46A3Q7Z3Q1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A3Q7Z3Q1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC46A3Q7Z3Q1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A3Q7Z3Q1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms