Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETXQ7Z333 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SETXQ7Z333 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETXQ7Z333 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETXQ7Z333 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETXQ7Z333 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.5 ms