Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP3Q7RTS5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP3Q7RTS5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP3Q7RTS5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP3Q7RTS5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
OTOP3Q7RTS5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms