Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMIM5Q71RC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
SMIM5Q71RC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMIM5Q71RC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SMIM5Q71RC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMIM5Q71RC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SMIM5Q71RC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms