Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
LRRC9Q6ZRR7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
LRRC9Q6ZRR7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.05■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
LRRC9Q6ZRR7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
LRRC9Q6ZRR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
LRRC9Q6ZRR7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
LRRC9Q6ZRR7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
LRRC9Q6ZRR7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.95
LRRC9Q6ZRR7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms