Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD1Q6UWL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD1Q6UWL2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD1Q6UWL2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms