Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMCO3Q6UWJ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO3Q6UWJ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO3Q6UWJ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMCO3Q6UWJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms