Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL35Q6PF15 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL35Q6PF15 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL35Q6PF15 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms