Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1Q6PCB7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC27A1Q6PCB7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A1Q6PCB7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A1Q6PCB7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms