Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRNIPQ6NTE8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRNIPQ6NTE8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRNIPQ6NTE8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRNIPQ6NTE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms