Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT80Q6KB66 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT80Q6KB66 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT80Q6KB66 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT80Q6KB66 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT80Q6KB66 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms