Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAF1Q6GPH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAF1Q6GPH4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAF1Q6GPH4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAF1Q6GPH4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAF1Q6GPH4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XAF1Q6GPH4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAF1Q6GPH4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms