Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2CLQ60I27 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CLQ60I27 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ALS2CLQ60I27 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms