Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF38BQ5VTL8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF38BQ5VTL8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF38BQ5VTL8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF38BQ5VTL8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF38BQ5VTL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms