Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATPAF1Q5TC12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATPAF1Q5TC12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATPAF1Q5TC12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATPAF1Q5TC12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATPAF1Q5TC12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPAF1Q5TC12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPAF1Q5TC12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPAF1Q5TC12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPAF1Q5TC12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPAF1Q5TC12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms