Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM27D1Q5T7N8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM27D1Q5T7N8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms