Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZK1Q5T2W1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZK1Q5T2W1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1693.2 ms