Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CFAP70Q5T0N1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
CFAP70Q5T0N1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFAP70Q5T0N1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CFAP70Q5T0N1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFAP70Q5T0N1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms