Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D4BQ5SQS7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SH2D4BQ5SQS7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms