Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNT1Q5JUK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNT1Q5JUK3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT1Q5JUK3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms