Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NOM1Q5C9Z4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NOM1Q5C9Z4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOM1Q5C9Z4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOM1Q5C9Z4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms