Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229BQ4G0N7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229BQ4G0N7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms