Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q499Y3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q499Y3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q499Y3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q499Y3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q499Y3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q499Y3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q499Y3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q499Y3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q499Y3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q499Y3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q499Y3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q499Y3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q499Y3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q499Y3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q499Y3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q499Y3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q499Y3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q499Y3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q499Y3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q499Y3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q499Y3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q499Y3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q499Y3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q499Y3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q499Y3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q499Y3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q499Y3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q499Y3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q499Y3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q499Y3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q499Y3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q499Y3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q499Y3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q499Y3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q499Y3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q499Y3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q499Y3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q499Y3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q499Y3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q499Y3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q499Y3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q499Y3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q499Y3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q499Y3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q499Y3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q499Y3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q499Y3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q499Y3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q499Y3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q499Y3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q499Y3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q499Y3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q499Y3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q499Y3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q499Y3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q499Y3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q499Y3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q499Y3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q499Y3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q499Y3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q499Y3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q499Y3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q499Y3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q499Y3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q499Y3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q499Y3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q499Y3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q499Y3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q499Y3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q499Y3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q499Y3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q499Y3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q499Y3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q499Y3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q499Y3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q499Y3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q499Y3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q499Y3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q499Y3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q499Y3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q499Y3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q499Y3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q499Y3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q499Y3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q499Y3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms