Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC36A3Q495N2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC36A3Q495N2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC36A3Q495N2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms