Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00303Q3SY05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00303Q3SY05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00303Q3SY05 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00303Q3SY05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms