Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4EQ3MJ16 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G4EQ3MJ16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G4EQ3MJ16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms