Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM12Q3MHD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM12Q3MHD2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM12Q3MHD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM12Q3MHD2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms