Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2Q2TAL6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWC2Q2TAL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWC2Q2TAL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWC2Q2TAL6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWC2Q2TAL6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms