Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDUFA9Q16795 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFA9Q16795 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFA9Q16795 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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