Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIST3H3Q16695 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIST3H3Q16695 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST3H3Q16695 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST3H3Q16695 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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