Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2Q16621 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2Q16621 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFE2Q16621 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2Q16621 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297 ms