Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms