Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF2Q15527 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF2Q15527 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF2Q15527 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF2Q15527 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SURF2Q15527 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SURF2Q15527 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SURF2Q15527 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SURF2Q15527 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SURF2Q15527 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SURF2Q15527 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SURF2Q15527 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SURF2Q15527 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SURF2Q15527 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SURF2Q15527 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SURF2Q15527 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SURF2Q15527 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SURF2Q15527 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SURF2Q15527 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SURF2Q15527 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SURF2Q15527 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SURF2Q15527 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SURF2Q15527 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms