Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDSNQ15517 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDSNQ15517 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDSNQ15517 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDSNQ15517 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms