Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
UBE3CQ15386 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
UBE3CQ15386 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE3CQ15386 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBE3CQ15386 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE3CQ15386 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
UBE3CQ15386 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE3CQ15386 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
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