Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.66e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 318.76■□□□□ 0.596e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.596e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.586e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.586e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RAC1-204ENST00000488373 845 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.566e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-212ENST00000568773 499 ntTSL 218.51■□□□□ 0.556e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.536e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 518.3■□□□□ 0.521e-7■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-208ENST00000564039 518 ntTSL 218.13■□□□□ 0.496e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 518.1■□□□□ 0.496e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.476e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.476e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.446e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.436e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.426e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.426e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 217.47■□□□□ 0.396e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.366e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.366e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.346e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.336e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 217.01■□□□□ 0.316e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-207ENST00000456420 755 ntTSL 317■□□□□ 0.316e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 416.98■□□□□ 0.316e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.286e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.276e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 416.72■□□□□ 0.276e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.266e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.256e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.226e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-208ENST00000461888 2277 ntTSL 516.42■□□□□ 0.226e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 HDLBP-223ENST00000449864 529 ntTSL 516.38■□□□□ 0.216e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.216e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.186e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 AC087289.3-201ENST00000590947 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.1■□□□□ 0.176e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.166e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.136e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.136e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-207ENST00000468428 2200 ntTSL 215.83■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.096e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.076e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NSMF-207ENST00000371482 2888 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.076e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.066e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.066e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.016e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.016e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 415.08■□□□□ 06e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.026e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.076e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 314.55□□□□□ -0.086e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MRPL38-212ENST00000486101 767 ntTSL 214.53□□□□□ -0.086e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TBC1D9B-217ENST00000522472 668 ntTSL 514.48□□□□□ -0.096e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 LZTR1-217ENST00000497716 1031 ntTSL 514.48□□□□□ -0.096e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FAM207A-205ENST00000485207 504 ntTSL 214.43□□□□□ -0.16e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.166e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.166e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.186e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.226e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.246e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 413.54□□□□□ -0.246e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MRPL38-217ENST00000588620 498 ntTSL 313.27□□□□□ -0.296e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.316e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RAC1-205ENST00000495499 615 ntTSL 212.48□□□□□ -0.416e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.456e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C22orf34-206ENST00000444628 453 ntTSL 512.06□□□□□ -0.486e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.56e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.526e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.526e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.526e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.536e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.546e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 411.59□□□□□ -0.556e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 LZTR1-208ENST00000461510 413 ntTSL 211.58□□□□□ -0.566e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.566e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-216ENST00000495887 919 ntTSL 311.53□□□□□ -0.566e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 HDLBP-227ENST00000458564 420 ntTSL 311.5□□□□□ -0.576e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.576e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ZNFX1-205ENST00000455070 2122 ntTSL 211.41□□□□□ -0.586e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 AC087289.3-202ENST00000593156 4270 ntTSL 211.38□□□□□ -0.596e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RAC1-206ENST00000497741 651 ntTSL 210.79□□□□□ -0.686e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.746e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TBC1D9B-219ENST00000524222 927 ntTSL 510.36□□□□□ -0.756e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MRPL38-208ENST00000477371 566 ntTSL 210.12□□□□□ -0.796e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MRPL38-211ENST00000483393 525 ntTSL 210.01□□□□□ -0.816e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.826e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MRPL38-207ENST00000477023 446 ntTSL 39.69□□□□□ -0.866e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CAPN2-202ENST00000433674 3264 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.866e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MRPL38-210ENST00000480203 534 ntTSL 39.53□□□□□ -0.886e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CAPN2-210ENST00000492565 331 ntTSL 59.39□□□□□ -0.916e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.916e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 IGF2BP2-210ENST00000494906 918 ntTSL 58.87□□□□□ -0.996e-6■■■■□ 24.2
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