Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IKBKEQ14164 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKEQ14164 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IKBKEQ14164 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKEQ14164 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IKBKEQ14164 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IKBKEQ14164 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IKBKEQ14164 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IKBKEQ14164 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
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