Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKAP5Q14008 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP5Q14008 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP5Q14008 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP5Q14008 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms