Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms