Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX39BQ13838 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX39BQ13838 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX39BQ13838 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX39BQ13838 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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