Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL3Q13618 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL3Q13618 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CUL3Q13618 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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