Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BFSP2Q13515 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BFSP2Q13515 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BFSP2Q13515 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
BFSP2Q13515 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BFSP2Q13515 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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