Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF6Q13247 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRSF6Q13247 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRSF6Q13247 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF6Q13247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF6Q13247 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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