Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECH1Q13011 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECH1Q13011 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECH1Q13011 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms