Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYO1EQ12965 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MYO1EQ12965 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MYO1EQ12965 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MYO1EQ12965 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYO1EQ12965 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MYO1EQ12965 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MYO1EQ12965 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1EQ12965 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1EQ12965 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1EQ12965 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1EQ12965 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1EQ12965 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1EQ12965 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1EQ12965 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1EQ12965 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1EQ12965 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYO1EQ12965 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYO1EQ12965 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MYO1EQ12965 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYO1EQ12965 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MYO1EQ12965 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MYO1EQ12965 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MYO1EQ12965 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MYO1EQ12965 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYO1EQ12965 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms