Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFSWAPQ12872 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFSWAPQ12872 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SFSWAPQ12872 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFSWAPQ12872 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
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